2009年  

　　（1）与加拿大遥感中心、美国Oklahoma大学、North  Carolina大学、Toledo大学以及丹麦Aarhus 大学等建立了长期合作关系，就汉江流域人类活动与水环境关系、大型工程生态安全等开展合作； 

　　（2）与英国Centre for Ecology & Hydrology、美国弗罗里达大学植物学系和丹麦Aarhus 大学等在湖泊生态系统领域建立了良好的合作关系； 

　　（3）与美国农部农业研究局、林务局等在入侵生物与生物安全方面开展了全面合作，先后在黑藻、乌桕、虎杖、杠板归、悬钩子等生物防治方面签署了合作协议，每年合作经费达80-100万元； 

　　（4）与国际植物营养研究所合作，承担了“几种优良园林绿化植物的规模种植配方施肥研究”、“江汉平原速生杨树施肥对土壤环境的影响及农林复合模式研究”，合同经费150万元； 

　　（5）广泛加强国际和合作与交流，执行了包括美国莱斯大学生态与进化系系主任Evan Siemann博士、美国内华达大学自然资源与环境科学系主任Kurt Pregitzer博士的2个中国科学院外国专家特聘研究员计划。 

　　2010年 

　　（1）在入侵植物研究方面，与美国莱斯大学、美国农业部入侵植物实验室密切合作，在外来植物传入机理及生态学效应方面开展研究，合作结果在国际著名生态学杂志发表。 

　　（2）在目前开展肯尼亚生物多样性调查的基础上，逐步拓展坦桑尼亚、苏丹、埃塞俄比亚、博茨瓦纳、纳米比亚、马达加斯加等非洲国家的生物多样性保护与研究，通过技术及人员培训、联合研究、野外台站建设等途径，建设“中国科学院非洲生物多样性研究中心”，服务中-非战略合作。已成立了武汉植物园“非洲生物多样性研究中心”，并与肯尼亚“乔莫·肯尼亚塔农业与技术大学”签订生物多样性保护与人才交流合作协议。同时，前期组织院内有关研究所对肯尼亚、乍得、南非及喀麦隆等非洲国家生物多样性现状进行了多次考察，为非洲有关国家培养和输送了生物多样性方面的专业研究人员。