淫羊藿为小檗科淫羊藿属植物，是我国常用大宗中药材，具有较多的药用价值和广阔的开发前景。当前淫羊藿药材主要依靠野生资源，存在基原植物混乱、质量参差不齐等问题。叶体绿基因组信息可以用于植物的系统分类、品种鉴定，但目前还没有对我国淫羊藿属植物开展过叶绿体基因组的研究。
中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室张燕君副研究员在王瑛研究员的指导下，与韩国首尔大学的Tae-Jin Yang教授合作，首次对我国 4 种淫羊藿属植物叶绿体基因组进行了全测序。结合前期报道的韩国 1 个淫羊藿物种的叶绿体基因组序列，对淫羊藿属叶绿体基因组进行了深入的分析。研究结果表明不同淫羊藿物种间存在反向重复区（IR）收缩和扩张的差异；基因trnQ-UUG在大单拷贝区（LSC）发生了复制事件，这在其他基部双子叶植物中还未见报道。同时，本研究还筛选了一批淫羊藿叶绿体基因组的多态性DNA片段、SSR位点、REPuter位点，可用于该属植物的系统分类、品种鉴定、居群遗传学研究。基于叶绿体基因组全序列，本研究对这 5 个淫羊藿物种进行了系统发育重建，结果支持淫羊藿与地理分布密切相关的属下大类群的划分，但也指出中国淫羊藿属植物的演化关系和属下系统划分还需要进一步的研究和完善。
研究结果对于淫羊藿属植物的系统演化分析、品种鉴定具有重要的意义，目前该研究结果在线发表在Frontiers in Plant Science 杂志上。
淫羊藿物种间叶绿体基因组LSC，SSC以及IR区边界位置比较
