Streptocarpus ionanthus是海角苣苔属（Streptocarpus）物种，隶属于苦苣苔科（Gesneriaceae），为肯尼亚和坦桑尼亚特有植物，具有很高的观赏价值。该物种被分为9个亚种，通过亚种之间杂交，产生花色各异的品种，在美洲和欧洲市场广受欢迎。 Str. ionanthus是Saintpaulia组中唯一生长在密林之外，受人为影响较严重的生境中的物种，导致种群数量逐渐下降，根据国际自然保护联盟（ICUN）濒危物种红色名录，该类群的Str. ionanthus subsp. rupicola，Str. ionanthus subsp. velutinus，Str. ionanthus subsp. grandifolius，Str. ionanthus subsp. orbicularis等处于濒危状态。前人对海角苣苔属系统进化的研究中，利用核基因片段序列和叶绿体基因片段序列的一些研究，虽然取得了一些进展，但对于较低等级分类单元的分类处理上存在的问题，仍然没有得到很好的解决。 

当前，在海角苣苔属Saintpaulia组中仅有一个叶绿体基因组数据被报道，未见到该组中Str. ionanthus的基因组数据信息，重点实验室博士研究生Cornelius Mulili Kyalo对收集于坦桑尼亚和肯尼亚的Str. ionanthus的五个亚种进行了叶绿体全基因组测序，分别为Str. ionanthus subsp. rupicola，Str. ionanthus subsp. velutinus，Str. ionanthus subsp. grandifolius，Str. ionanthus subsp. orbicularis，Str. ionanthus subsp. grotei，其基因组大小从153,208 bp（Str. ionanthus subsp. grandifolius）到 153,377 bp（Str. ionanthus subsp. orbicularis），均编码115个基因。该研究与Saintpaulia组已报道的Str. teitensis进行比较结果显示，基因的排列顺序，基因组结构均表现出高度保守性，在四分结构中，IR区更为保守（图 1）。研究通过IR边界，以及序列上的微卫星（图 2）等方面的比较，均表现出叶绿体基因组的保守性。

该研究从基因编码区和基因间区，筛选出了五个可变区(psbM，rps3，atpF-atpH，psbC-psbZ，psaA-ycf 3），和五个具有大量多态性位点的基因（rps16，rpoC2，rpoB，ycf 1， ndhA），为进一步应用在系统发育研究中提供数据。该研究基于全基因组序列，蛋白编码基因以及基因间区，利用最大似然法和贝叶斯推断重建了物种的系统发育树（图 3），在三个系统树中，基于有限的序列数据，五个亚种之间并未很好的分离，且分辨率仍不够高，这与之前的研究结果较为相似。但该研究报道的Str. ionanthus五个亚种叶绿体基因组数据，为今后阐明其系统发育关系提供了重要的序列资源，相关的进一步研究正在进行中。  

研究成果以“The First Glimpse of Streptocarpus ionanthus (Gesneriaceae) Phylogenomics: Analysis of Five Subspecies’Chloroplast Genomes”为题，近期在线发表于国际学术期刊《Plants》上。 

论文链接：https://www.mdpi.com/2223-7747/9/4/456 

　　图 1 基因组结构重排分析 

　　图 2 微卫星比较分析 

图 3 基于叶绿体全基因组、蛋白编码基于以及基因间区构建的ML树和BI树