应中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室系统与进化植物学学科组李建强研究员的邀请,美国北卡罗来纳大学孟少武博士于6月25日到重点实验室开展学术交流,并为科研人员和研究生作了题为“Gene ontology annotation of the rice blast fungus, Maganaporthe grisea”的学术报告。
孟少武详细介绍了基因本体(Gene Ontology,GO)的概念和研究内容,以及在稻瘟病病菌全基因组注释过程中的应用。基因本体作为一个研究热点,在世界范围内被广泛接受和应用,它主要包括三个领域:生物过程、分子功能和细胞组件。随着多种生物genome的相继解码,同时大量ESTs以及gene expression profile date的积累,使得annotation的工作量和复杂度大大增加。然而另一方面,在不同的真核生物中,很多基因拥有相同或相似的功能,通过在某些物种中获得的基因或者蛋白质(shared protein)的生物学信息,可以用以解释其他物种中对应的基因或蛋白(especially in comparative genomics)。由于这些繁复的功能信息主要是包含在积累的文献之中,如何有效的提取和综合这些信息就是我们面临的核心困难,这也是GO所要着力解决的问题。讲座结束后,孟少武与科研人员及研究生进行了深入探讨,大家受益匪浅。
孟少武,2001年在中科院昆明植物所获得植物分子生物学博士学位。2001年至今,先后在新加坡信息通信研究院、加拿大多伦多大学、美国北卡罗来纳州立大学、北卡罗来纳大学从事玉米黑粉菌、稻瘟病菌、人类癌症及人类病毒的生物信息学和基因组学研究。在Nature、Microbiol Mol Biol Rev、Trends Microbiol、Nucleic Acids Res、Genome Biol和Bioinformatics等学术期刊发表研究性和综述性论文十多篇。
美国北卡罗来纳大学孟少武博士访问重点实验室
孟少武博士作学术讲座